Logo
Information on SUBCLASS 3.2.2
Subclass Accession number: 4673
Subclass: 3.2.2 PSSM
Type: HH alpha-alpha
DB: ArchDB95

Image coordinates: Rasmol PDB Jmol PDB
Consensus coordinates: Rasmol PDB Jmol PDB
Number of loops: 9

Average sequence ID (%) : 13.9 +/- 14.9
Average RMSD (Å) : 0.900 +/- 0.245

Consensus geometry
d (Å): 11 delta (°): 90-135 theta (°): 135-180 rho (°): 135-180
Consensus Sequence: XXGXXXp
(φψ)-conformation: aagppaa
Pattern: xxx[acil]xxx[DG]x[DGNPS][iklmt][dehks]x[AFILMPY][fiklm]xx
Conservation:-0.475-0.885-0.4110.012-0.191-0.277-0.4733.621-0.1350.430-0.2100.589-0.553-0.055-0.045-0.361-0.581
Loops included in this Subclass
LoopPDBChainStartEndSequenceSec StructRamachandran
1c7q_A_2111c7q   A211227LLPIAVAGLNIDRMMEGHHHHHHTT--HHHHHHHaaaaaaavxxaaaaaaa
1nnw_A_2271nnw   A230246EERIRAEGLPEEIIKILHHHHHHHT--HHHHHHHaaaaaaavxpaaaaaaa
1ols_A_1161ols   A116132AGVLMYRDYPLELFMAQHHHHHHTT--HHHHHHHaaaaaaavxxaaaaaaa
1qy5_A_1691qy5   A178194MTEAQEDGQSTSELIGQHHHHHHHT---HHHHHHaaaaaaavxpaaaaaaa
1rkx_A_3221rkx   A332348WHKNWLSGTDMHEYSITHHHHHHTT--HHHHHHHaaaaaaavxxaaaaaaa
1rzh_L_841rzh   L105121VEICRKLGIGYHIPFAFHHHHHHHT--SHHHHHHaaaaaaavbxaaaaaaa
1rzh_M_1131rzh   M134150YLRAQALGMGKHTAWAFHHHHHHTT--SHHHHHHaaaaaaavxxaaaaaaa
1ujp_A_2301ujp   A232248LVRALEEGRSLAPLLQEHHHHHHTT--HHHHHHHaaaaaaavxxaaaaaaa
1umd_A_981umd   A98114HGLALALGIPLKELLGQHHHHHHHT--HHHHHHHaaaaaaagxpaaaaaaa
PDB ligands within a cut-off distance of 6 Å in this subclass
LoopPDBChainLigandsResidue
1qy5_A_1691qy5   A     NECN-ETHYL-5'-CARBOXAMIDO ADENOSINE T - 171
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A I - 89
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A C - 92
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A A - 93
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A A - 96
1rzh_L_841rzh   L     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A F - 97
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A F - 97
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL F - 97
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL V - 98
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A W - 100
1rzh_L_841rzh   L     U10UBIQUINONE-10 W - 100
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL A - 101
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL L - 102
1rzh_L_841rzh   L     U10UBIQUINONE-10 R - 103
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A E - 104
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL V - 105
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL Y - 115
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE W - 115
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A H - 116
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE L - 116
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A I - 117
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL I - 117
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A P - 118
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL P - 118
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL F - 119
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE S - 119
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A A - 120
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL A - 120
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE F - 120
1rzh_L_841rzh   L     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A F - 121
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A F - 121
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL F - 121
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A A - 122
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL A - 122
1rzh_M_1131rzh   M     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A M - 122
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A M - 122
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE M - 122
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A F - 123
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE F - 123
1rzh_L_841rzh   L     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A A - 124
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A A - 124
1rzh_L_841rzh   L     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A I - 125
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A I - 125
1rzh_L_841rzh   L     HTOHEPTANE-1,2,3-TRIOL I - 125
1rzh_M_1131rzh   M     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A A - 125
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A A - 125
1rzh_M_1131rzh   M     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A V - 126
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A V - 126
1rzh_L_841rzh   L     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A A - 127
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A W - 127
1rzh_L_841rzh   L     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A Y - 128
1rzh_L_841rzh   L     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A Y - 128
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A W - 129
1rzh_M_1131rzh   M     U10UBIQUINONE-10 W - 129
1rzh_L_841rzh   L     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A T - 130
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A W - 130
1rzh_L_841rzh   L     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A L - 131
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A T - 133
1rzh_M_1131rzh   M     CDLCARDIOLIPIN M - 142
1rzh_M_1131rzh   M     CDLCARDIOLIPIN G - 143
1rzh_M_1131rzh   M     CDLCARDIOLIPIN K - 144
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A H - 145
1rzh_M_1131rzh   M     CDLCARDIOLIPIN H - 145
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A T - 146
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A A - 147
1rzh_M_1131rzh   M     CDLCARDIOLIPIN W - 148
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A A - 149
1rzh_M_1131rzh   M     CDLCARDIOLIPIN A - 149
1rzh_M_1131rzh   M     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A F - 150
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A F - 150
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A L - 151
1rzh_M_1131rzh   M     CDLCARDIOLIPIN L - 151
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A S - 152
1rzh_M_1131rzh   M     CDLCARDIOLIPIN S - 152
1rzh_M_1131rzh   M     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A A - 153
1rzh_M_1131rzh   M     BPHBACTERIOPHEOPHYTIN A A - 153
1rzh_M_1131rzh   M     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A I - 154
1rzh_M_1131rzh   M     CDLCARDIOLIPIN W - 155
1rzh_M_1131rzh   M     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A L - 156
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE L - 156
1rzh_M_1131rzh   M     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A W - 157
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE W - 157
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE M - 158
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE V - 159
1rzh_M_1131rzh   M     BCLBACTERIOCHLOROPHYLL A L - 160
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE L - 160
1rzh_M_1131rzh   M     SPOSPHEROIDENE G - 161
1ujp_A_2301ujp   A     CITCITRIC ACID S - 230
1ujp_A_2301ujp   A     CITCITRIC ACID A - 231

Clusters included in this Subclass
CLUSTER: HH.4.77