Logo
Information on SUBCLASS 23.1.1
Subclass Accession number: 5178
Subclass: 23.1.1 PSSM
Type: HH alpha-alpha
DB: ArchDB95

Image coordinates: Rasmol PDB Jmol PDB
Consensus coordinates: Rasmol PDB Jmol PDB

Conserved Annotation
GO : GO:0003700 (>75 %)  GO:0003707 (>75 %)  GO:0004872 (>75 %)  GO:0004879 (>75 %)  GO:0005496 (>75 %)  
SCOP : 57715 (>75 %)  57716 (>75 %)  57721 (>75 %)  
Number of loops: 3

Average sequence ID (%) : 49.6 +/- 5.5
Average RMSD (Å) : 0.733 +/- 0.115

Consensus geometry
d (Å): 15 delta (°): 90-135 theta (°): 90-135 rho (°): 180-225
Consensus Sequence: hpcpXpYXCXXpcpCXIDKXpRcpCXh
(φψ)-conformation: aappbbpbpaFalapppbaaaaaabaa
Pattern: [EG][GS][C][K][AGV][F][F][K][R][AST][IV][EQR][GK][DHQ]x[DNT][Y][LMT][C]x[ADG][NRT][KN][DQ][C][ILT][I][D][K]x[QR][R][KN][NRS][C][PQ][AY][C][R][LY][QR][K][C][LY][AEQ]
Conservation:-0.762-0.3741.9760.451-1.1160.8330.8330.4510.451-0.735-0.112-0.565-0.696-0.735-1.116-0.7351.214-0.8621.976-1.116-1.031-0.862-0.329-0.3201.976-0.9040.0700.8330.451-1.328-0.2820.451-0.404-0.8201.976-0.522-0.8451.9760.451-0.422-0.2820.4511.976-0.663-0.862
Loops included in this Subclass
LoopPDBChainStartEndSequenceSec StructRamachandran
1hcq_A_251hcq   A2569EGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEHHHHHHHHHHHSS------SSSS----STTTTTT-HHHHHHHHHHaaaaaaaaaaaaepbbxbbaFavaxxbbaaaaaabaaaaaaaaaa
1r4o_A_4581r4o   A458502GSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQHHHHHHHHHHHHS------SSSS-----TTGGGT-HHHHHHHHHHaaaaaaaaaaaaxxbbbbpaFavaxxxbaaaaaabaaaaaaaaaa
2nll_A_1532nll   A153197EGCKGFFKRTVRKDLTYTCRDNKDCLIDKRQRNRCQYCRYQKCLAHHHHHHHHHHHHT------SSSS-----TTTTTS-HHHHHHHHHHaaaaaaaaaaaaxxbbxbxaFalapxxbaaaaaabaaaaaaaaaa
PDB ligands within a cut-off distance of 6 Å in this subclass
LoopPDBChainLigandsResidue
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION E - 25
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION G - 26
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION C - 27
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION K - 28
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION M - 42
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION C - 43
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION P - 44
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION A - 45
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION T - 46
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION N - 47
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION Q - 48
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION C - 49
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION I - 51
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION R - 56
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION C - 59
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION A - 61
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION C - 62
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION R - 63
1hcq_A_251hcq   A     ZNZINC ION R - 65
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION G - 458
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION S - 459
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION C - 460
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION K - 461
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION L - 475
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION C - 476
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION A - 477
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION G - 478
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION R - 479
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION N - 480
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION D - 481
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION C - 482
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION R - 489
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION C - 492
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION A - 494
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION C - 495
1r4o_A_4581r4o   A     ZNZINC ION R - 496
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION E - 153
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION G - 154
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION C - 155
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION K - 156
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION C - 171
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION R - 172
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION D - 173
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION N - 174
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION K - 175
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION D - 176
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION C - 177
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION R - 184
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION C - 187
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION Q - 188
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION Y - 189
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION C - 190
2nll_A_1532nll   A     ZNZINC ION R - 191

Clusters included in this Subclass
CLUSTER: HH.23.1