------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ proporcions de residus per cada atom del nucleotid ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ | ALA | ARG | ASN | ASP | CYS | GLN | GLU | GLY | HIS | ILE | LEU | LYS | MET | PHE | PRO | SER | THR | TRP | TYR | VAL | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ O3* 0.06 0.06 0.04 0.08 0.00 0.05 0.10 0.00 0.03 0.06 0.10 0.06 0.00 0.04 0.05 0.01 0.08 0.00 0.03 0.08 O1G 0.09 0.08 0.03 0.12 0.02 0.01 0.06 0.00 0.02 0.03 0.06 0.07 0.02 0.04 0.02 0.03 0.08 0.01 0.09 0.07 N9 0.00 0.04 0.04 0.03 0.00 0.04 0.03 0.00 0.03 0.06 0.3 0.04 0.01 0.07 0.04 0.00 0.03 0.00 0.06 0.12 O2* 0.06 0.1 0.06 0.03 0.00 0.11 0.08 0.00 0.01 0.07 0.14 0.04 0.01 0.00 0.03 0.06 0.11 0.00 0.01 0.01 PB 0.01 0.12 0.08 0.06 0.04 0.07 0.11 0.00 0.02 0.04 0.02 0.07 0.00 0.06 0.00 0.05 0.01 0.01 0.07 0.13 C5 0.05 0.05 0.05 0.03 0.02 0.02 0.03 0.00 0.03 0.15 0.09 0.12 0.03 0.09 0.03 0.00 0.06 0.00 0.06 0.02 C4 0.03 0.02 0.05 0.03 0.02 0.05 0.11 0.00 0.05 0.12 0.11 0.05 0.03 0.05 0.03 0.05 0.06 0.00 0.02 0.11 O2B 0.09 0.02 0.03 0.04 0.00 0.01 0.09 0.00 0.00 0.05 0.04 0.11 0.04 0.03 0.05 0.05 0.13 0.00 0.04 0.14 O3B 0.03 0.05 0.03 0.08 0.00 0.02 0.08 0.00 0.05 0.02 0.06 0.03 0.05 0.03 0.02 0.07 0.14 0.00 0.05 0.10 C8 0.08 0.06 0.02 0.12 0.00 0.02 0.07 0.00 0.01 0.06 0.07 0.11 0.00 0.08 0.06 0.04 0.01 0.01 0.02 0.05 N3 0.02 0.02 0.08 0.04 0.00 0.06 0.06 0.00 0.00 0.15 0.09 0.07 0.03 0.03 0.02 0.00 0.11 0.00 0.04 0.07 C3* 0.04 0.03 0.00 0.12 0.04 0.07 0.05 0.00 0.00 0.07 0.08 0.05 0.00 0.01 0.09 0.03 0.09 0.01 0.01 0.08 O2G 0.02 0.04 0.04 0.01 0.00 0.09 0.07 0.00 0.06 0.04 0.16 0.06 0.01 0.02 0.05 0.06 0.08 0.01 0.01 0.06 O5* 0.04 0.03 0.05 0.07 0.00 0.03 0.07 0.00 0.01 0.04 0.07 0.07 0.05 0.09 0.04 0.04 0.07 0.00 0.11 0.07 N7 0.03 0.05 0.03 0.07 0.00 0.07 0.07 0.00 0.07 0.1 0.09 0.05 0.07 0.00 0.00 0.01 0.03 0.00 0.02 0.13 N6 0.06 0.05 0.01 0.02 0.02 0.04 0.11 0.00 0.03 0.05 0.16 0.12 0.01 0.04 0.03 0.04 0.03 0.02 0.03 0.06 C1* 0.1 0.12 0.01 0.07 0.00 0.04 0.05 0.00 0.02 0.1 0.06 0.06 0.05 0.06 0.04 0.02 0.04 0.02 0.04 0.05 PG 0.05 0.04 0.03 0.06 0.01 0.02 0.04 0.00 0.03 0.04 0.10 0.07 0.03 0.12 0.02 0.05 0.1 0.00 0.06 0.07 O3G 0.04 0.07 0.06 0.02 0.00 0.06 0.05 0.00 0.05 0.06 0.07 0.08 0.00 0.12 0.01 0.05 0.08 0.00 0.05 0.06 C2* 0.00 0.05 0.06 0.06 0.00 0.08 0.11 0.00 0.05 0.06 0.14 0.06 0.00 0.05 0.03 0.08 0.03 0.02 0.03 0.08 O2A 0.09 0.17 0.03 0.03 0.00 0.01 0.08 0.00 0.03 0.04 0.07 0.07 0.03 0.04 0.00 0.07 0.09 0.00 0.04 0.09 C6 0.01 0.04 0.06 0.09 0.00 0.06 0.09 0.00 0.00 0.01 0.07 0.09 0.07 0.04 0.03 0.03 0.03 0.00 0.03 0.10 N1 0.00 0.11 0.05 0.01 0.00 0.02 0.12 0.00 0.00 0.05 0.09 0.1 0.09 0.01 0.06 0.02 0.04 0.02 0.02 0.07 O1B 0.1 0.05 0.02 0.05 0.00 0.02 0.09 0.00 0.02 0.02 0.1 0.1 0.02 0.07 0.02 0.09 0.11 0.01 0.04 0.02 O3A 0.12 0.05 0.02 0.02 0.02 0.04 0.06 0.00 0.02 0.1 0.04 0.08 0.04 0.1 0.04 0.04 0.08 0.00 0.05 0.04 O1A 0.07 0.09 0.02 0.08 0.00 0.01 0.09 0.00 0.02 0.09 0.11 0.01 0.02 0.06 0.00 0.03 0.04 0.00 0.09 0.09 C5* 0.08 0.04 0.08 0.08 0.00 0.00 0.10 0.00 0.03 0.04 0.08 0.01 0.05 0.04 0.08 0.06 0.08 0.00 0.03 0.06 C4* 0.11 0.01 0.02 0.1 0.00 0.03 0.09 0.00 0.02 0.06 0.04 0.12 0.02 0.04 0.00 0.03 0.08 0.00 0.02 0.11 O4* 0.04 0.06 0.03 0.07 0.00 0.06 0.04 0.00 0.03 0.04 0.07 0.09 0.03 0.07 0.00 0.00 0.17 0.01 0.00 0.13 PA 0.02 0.06 0.06 0.08 0.01 0.02 0.06 0.00 0.01 0.05 0.05 0.11 0.1 0.04 0.01 0.05 0.06 0.00 0.04 0.04 C2 0.12 0.05 0.04 0.03 0.00 0.01 0.09 0.00 0.03 0.05 0.05 0.04 0.04 0.08 0.05 0.01 0.08 0.00 0.03 0.12 *HO2 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.17 0.00 0.08 0.00 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 2HN6 0.00 0.1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.1 0.2 0.4 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.2 1HN6 0.00 0.13 0.13 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.00 0.13 0.00 0.07 0.13 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.13 0.00 O2P 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.5 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.5 P 0.00 0.00 0.00 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 H61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 H2* 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 La proteina pdb1gtr.ent te aquests residus a una distancia maxima de 5 A dels seus atoms: ------------------------------------------ atom residu distancia(A) ------------------------------------------ C1* GLU 3.32716831555003 N7 ASN 3.54270306404587 C8 HIS 4.87634463507246 O4* SER 4.48575133060227 O2* VAL 4.12225096276294 PA GLU 4.14909050274876 C4* PHE 4.63583433698833 N3 ARG 4.4444577847022 O3B LEU 4.83118049755958 O3G LYS 3.25379609072234 N3 VAL 4.21722183433597 N3 THR 3.69835125427534 la probabilitat de trobar els residus concrets d'aquesta proteina aprop dels atoms del nucleotid es: 10 exp -35.8626144010973 !!!!!!!!!