Diapositiva PPT
Les flavodoxines són un grup de flavoproteïnes de petit tamany (18-20 kDa) implicades totes elles en la transferència d’electrons en les reaccions redox. Aquestes proteïnes s’uneixen de forma no covalent al cofactor FMN (flavina mononucleòtid) el qual participa a les reaccions reduïnt-se i oxidant-se després. La transferència d’electrons és necessària en processos biològics com fixació de nitrògen, producció d’ hidrògens, reducció de sulfat i fotosíntesis en alguns organismes.
Aquestes proteïnes pertanyen a un gran grup composat per nou superfamilies. Grup que es caracteritza per reunir proteïnes que entre elles presenten un elevat grau d’homologia estructural (plegament “flavodoxin-like”), però una baixa o nul.la similitud de seqüència i/o funció.
Estructuralment pertanyen a la classe alfa/beta, formant el que es coneix com estructura supersecundaria en fulla oberta.
En el cas de les flavodoxines, aquesta estructura comprèn una fulla b integrada per un nombre variable de làmines paral.leles, envoltada a banda i banda per un nombre també variable d’a-hèlixs.
El centre actiu de l’enzim, lloc d’unió al FMN, es troba a l’escletxa formada pels llaços de l’extrem carboxil de les cadenes b. Concretament al punt on té lloc el canvi d’orientació de les cadenes (topological switch point).
L’objectiu del treball ha estat el modelatge d’un membre d’aquesta familia, la flavodoxina de Bacillus subtilis, per al qual encara no s’ha resolt l’estructura mitjançant cristal.lografia de raig X.