# model2G.hmm.pdb # model2G.hmmxemnum010.gsf # === XAM --> Examine Structures =========== # ============== BESTFT ==================== # # # # RMSD table # # 1 2 # 1 2.17 # 2 0.00 # # Backbone atoms are : N CA C P O5' C5' C4' C3' O3' # # residues considered : 1..288 # # num. of residues considered: 288 (100%) # # mean global backbone RMSD : 2.17 +/- 0.00 A (2.17..2.17 A) # mean global heavy atom RMSD: 0.00 +/- 0.00 A (0.00..0.00 A) # # The meaning of the first five columns is: # BB(local), Heavy(local), BB(global), Heavy(global), SC(side chain) 5 1 0.00 0.00 0.53 0.00 1.22 VAL 2 0.16 0.00 0.42 0.00 1.04 ASN 3 0.11 0.00 0.30 0.00 0.53 GLU 4 0.12 0.00 0.48 0.00 1.32 LEU 5 0.10 0.00 0.41 0.00 0.52 PRO 6 0.10 0.00 0.36 0.00 0.55 GLU 7 0.13 0.00 0.39 0.00 0.00 GLY 8 0.13 0.00 0.54 0.00 2.52 ILE 9 0.14 0.00 0.44 0.00 0.58 LYS 10 0.13 0.00 0.34 0.00 1.23 VAL 11 0.13 0.00 0.42 0.00 2.44 ILE 12 0.14 0.00 0.35 0.00 0.40 LYS 13 0.15 0.00 0.42 0.00 0.38 ALA 14 0.11 0.00 0.52 0.00 0.47 PRO 15 0.11 0.00 0.65 0.00 0.76 GLU 16 0.11 0.00 0.70 0.00 1.62 MET 17 0.13 0.00 0.60 0.00 0.39 TRP 18 0.13 0.00 0.59 0.00 0.58 ALA 19 0.13 0.00 0.63 0.00 0.59 LYS 20 0.13 0.00 0.68 0.00 0.00 GLY 21 0.17 0.00 0.58 0.00 0.78 VAL 22 0.15 0.00 0.28 0.00 0.69 LYS 23 0.13 0.00 0.47 0.00 0.00 GLY 24 0.23 0.00 0.44 0.00 0.65 LYS 25 0.27 0.00 0.67 0.00 0.75 ASN 26 0.23 0.00 0.69 0.00 2.87 ILE 27 0.12 0.00 0.71 0.00 0.76 LYS 28 0.12 0.00 0.58 0.00 1.51 VAL 29 0.12 0.00 0.58 0.00 0.50 ALA 30 0.13 0.00 0.60 0.00 1.55 VAL 31 0.11 0.00 0.52 0.00 0.81 LEU 32 0.18 0.00 0.43 0.00 0.54 ASP 33 0.21 0.00 0.59 0.00 0.62 THR 34 0.20 0.00 0.81 0.00 0.00 GLY 35 0.16 0.00 0.55 0.00 0.95 CYS 36 0.16 0.00 0.43 0.00 0.54 ASP 37 0.14 0.00 0.71 0.00 0.87 THR 38 0.17 0.00 0.45 0.00 0.44 SER 39 0.19 0.00 0.26 0.00 0.57 HIS 40 0.28 0.00 0.22 0.00 0.59 PRO 41 0.18 0.00 0.75 0.00 0.68 ASP 42 0.38 0.00 0.86 0.00 0.97 LEU 43 0.46 0.00 0.46 0.00 0.63 LYS 44 0.37 0.00 0.71 0.00 0.69 ASN 45 0.37 0.00 0.87 0.00 0.61 GLN 46 0.34 0.00 1.12 0.00 2.06 ILE 47 0.21 0.00 1.05 0.00 2.80 ILE 48 0.15 0.00 0.87 0.00 0.00 GLY 49 0.15 0.00 0.50 0.00 0.00 GLY 50 0.23 0.00 0.49 0.00 0.76 LYS 51 0.15 0.00 0.48 0.00 0.70 ASN 52 0.19 0.00 0.58 0.00 0.66 PHE 53 0.16 0.00 0.73 0.00 0.71 THR 54 0.13 0.00 0.55 0.00 0.37 ASP 55 0.18 0.00 0.58 0.00 0.79 ASP 56 0.34 0.00 0.87 0.00 0.77 ASP 57 0.30 0.00 1.36 0.00 0.00 GLY 58 0.24 0.00 0.98 0.00 0.00 GLY 59 0.20 0.00 0.75 0.00 0.68 LYS 60 0.17 0.00 0.74 0.00 1.14 GLU 61 0.21 0.00 0.41 0.00 0.75 ASP 62 0.12 0.00 0.41 0.00 0.42 ALA 63 0.14 0.00 0.38 0.00 2.92 ILE 64 0.15 0.00 0.20 0.00 0.18 SER 65 0.10 0.00 0.26 0.00 0.31 ASP 66 0.11 0.00 0.32 0.00 0.14 TYR 67 0.13 0.00 0.41 0.00 0.75 ASN 68 0.16 0.00 0.29 0.00 0.00 GLY 69 0.13 0.00 0.21 0.00 0.37 HIS 70 0.12 0.00 0.16 0.00 0.00 GLY 71 0.11 0.00 0.21 0.00 0.23 THR 72 0.10 0.00 0.11 0.00 0.25 HIS 73 0.10 0.00 0.17 0.00 1.36 VAL 74 0.09 0.00 0.25 0.00 0.38 ALA 75 0.12 0.00 0.20 0.00 0.00 GLY 76 0.11 0.00 0.13 0.00 0.43 THR 77 0.17 0.00 0.24 0.00 1.74 ILE 78 0.19 0.00 0.42 0.00 1.23 ALA 79 0.20 0.00 0.34 0.00 0.44 ALA 80 0.17 0.00 0.49 0.00 0.74 ASN 81 0.12 0.00 0.42 0.00 0.90 ASP 82 0.20 0.00 0.29 0.00 0.48 SER 83 0.17 0.00 0.20 0.00 0.53 ASN 84 0.26 0.00 0.42 0.00 0.00 GLY 85 0.27 0.00 0.29 0.00 0.00 GLY 86 0.22 0.00 0.32 0.00 2.59 ILE 87 0.18 0.00 0.21 0.00 0.31 ALA 88 0.12 0.00 0.15 0.00 0.00 GLY 89 0.11 0.00 0.17 0.00 0.97 VAL 90 0.08 0.00 0.33 0.00 0.58 ALA 91 0.14 0.00 0.23 0.00 0.44 PRO 92 0.12 0.00 0.52 0.00 1.10 GLU 93 0.18 0.00 0.59 0.00 0.47 ALA 94 0.18 0.00 0.53 0.00 0.33 SER 95 0.15 0.00 0.48 0.00 0.84 LEU 96 0.15 0.00 0.55 0.00 0.99 LEU 97 0.08 0.00 0.46 0.00 3.01 ILE 98 0.08 0.00 0.49 0.00 0.99 VAL 99 0.16 0.00 0.44 0.00 0.38 LYS 100 0.11 0.00 0.29 0.00 1.00 VAL 101 0.13 0.00 0.25 0.00 0.62 LEU 102 0.20 0.00 0.65 0.00 0.00 GLY 103 0.29 0.00 0.37 0.00 0.00 GLY 104 0.28 0.00 0.71 0.00 0.56 GLU 105 0.33 0.00 0.67 0.00 1.31 ASN 106 0.27 0.00 0.50 0.00 0.00 GLY 107 0.22 0.00 0.12 0.00 0.45 SER 108 0.18 0.00 0.24 0.00 0.00 GLY 109 0.11 0.00 0.38 0.00 0.67 GLN 110 0.10 0.00 0.58 0.00 0.64 TYR 111 0.11 0.00 0.52 0.00 0.76 GLU 112 0.11 0.00 0.25 0.00 0.32 TRP 113 0.08 0.00 0.24 0.00 2.82 ILE 114 0.10 0.00 0.42 0.00 2.69 ILE 115 0.10 0.00 0.53 0.00 0.77 ASN 116 0.12 0.00 0.43 0.00 0.00 GLY 117 0.11 0.00 0.37 0.00 2.82 ILE 118 0.10 0.00 0.57 0.00 1.08 ASN 119 0.12 0.00 0.58 0.00 0.71 TYR 120 0.12 0.00 0.51 0.00 0.83 ALA 121 0.11 0.00 0.36 0.00 1.30 VAL 122 0.10 0.00 0.55 0.00 1.05 GLU 123 0.13 0.00 0.48 0.00 0.86 GLN 124 0.15 0.00 0.48 0.00 0.65 LYS 125 0.08 0.00 0.48 0.00 1.50 VAL 126 0.07 0.00 0.51 0.00 0.71 ASP 127 0.10 0.00 0.58 0.00 1.72 ILE 128 0.13 0.00 0.62 0.00 2.86 ILE 129 0.12 0.00 0.47 0.00 0.55 SER 130 0.10 0.00 0.41 0.00 0.46 MET 131 0.12 0.00 0.47 0.00 0.47 SER 132 0.20 0.00 0.53 0.00 0.87 LEU 133 0.28 0.00 0.67 0.00 0.00 GLY 134 0.22 0.00 0.31 0.00 0.00 GLY 135 0.20 0.00 0.17 0.00 0.24 PRO 136 0.15 0.00 0.74 0.00 0.88 SER 137 0.17 0.00 0.91 0.00 0.81 ASP 138 0.19 0.00 1.11 0.00 1.48 VAL 139 0.14 0.00 0.71 0.00 0.84 PRO 140 0.11 0.00 0.59 0.00 0.89 GLU 141 0.11 0.00 0.38 0.00 0.77 LEU 142 0.09 0.00 0.49 0.00 0.40 LYS 143 0.11 0.00 0.59 0.00 0.81 GLU 144 0.11 0.00 0.50 0.00 0.51 ALA 145 0.09 0.00 0.48 0.00 1.08 VAL 146 0.10 0.00 0.55 0.00 0.78 LYS 147 0.10 0.00 0.61 0.00 0.82 ASN 148 0.09 0.00 0.47 0.00 0.62 ALA 149 0.11 0.00 0.47 0.00 1.03 VAL 150 0.21 0.00 0.68 0.00 0.96 LYS 151 0.14 0.00 0.73 0.00 0.80 ASN 152 0.13 0.00 0.62 0.00 0.00 GLY 153 0.10 0.00 0.70 0.00 1.03 VAL 154 0.20 0.00 0.88 0.00 0.94 LEU 155 0.11 0.00 0.80 0.00 1.31 VAL 156 0.07 0.00 0.53 0.00 1.31 VAL 157 0.09 0.00 0.39 0.00 0.44 CYS 158 0.09 0.00 0.39 0.00 0.61 ALA 159 0.08 0.00 0.32 0.00 0.30 ALA 160 0.12 0.00 0.39 0.00 0.00 GLY 161 0.19 0.00 0.58 0.00 0.50 ASN 162 0.22 0.00 0.56 0.00 0.72 GLU 163 0.20 0.00 0.34 0.00 0.00 GLY 164 0.18 0.00 0.19 0.00 0.42 ASP 165 0.12 0.00 0.27 0.00 0.00 GLY 166 0.15 0.00 0.17 0.00 0.69 ASP 167 0.15 0.00 0.15 0.00 0.50 GLU 168 0.20 0.00 0.25 0.00 0.30 ARG 169 0.17 0.00 0.53 0.00 0.64 THR 170 0.14 0.00 0.50 0.00 0.74 GLU 171 0.14 0.00 0.44 0.00 0.66 GLU 172 0.19 0.00 0.70 0.00 1.00 LEU 173 0.27 0.00 0.79 0.00 0.89 SER 174 0.18 0.00 0.59 0.00 0.55 TYR 175 0.12 0.00 0.61 0.00 0.47 PRO 176 0.11 0.00 0.46 0.00 0.71 ALA 177 0.10 0.00 0.33 0.00 0.54 ALA 178 0.11 0.00 0.23 0.00 0.55 TYR 179 0.09 0.00 0.33 0.00 0.64 ASN 180 0.13 0.00 0.26 0.00 0.68 GLU 181 0.11 0.00 0.17 0.00 1.15 VAL 182 0.20 0.00 0.40 0.00 3.21 ILE 183 0.28 0.00 0.69 0.00 0.77 ALA 184 0.16 0.00 0.47 0.00 1.18 VAL 185 0.10 0.00 0.39 0.00 0.00 GLY 186 0.12 0.00 0.44 0.00 0.67 SER 187 0.15 0.00 0.50 0.00 0.62 VAL 188 0.15 0.00 0.38 0.00 0.57 SER 189 0.17 0.00 0.45 0.00 1.17 VAL 190 0.21 0.00 0.26 0.00 0.77 ALA 191 0.18 0.00 0.36 0.00 0.60 ARG 192 0.18 0.00 0.30 0.00 0.42 GLU 193 0.12 0.00 0.37 0.00 0.79 LEU 194 0.12 0.00 0.22 0.00 0.36 SER 195 0.13 0.00 0.28 0.00 0.35 GLU 196 0.11 0.00 0.29 0.00 0.35 PHE 197 0.10 0.00 0.31 0.00 0.15 SER 198 0.21 0.00 0.33 0.00 0.64 ASN 199 0.22 0.00 0.55 0.00 0.73 ALA 200 0.16 0.00 0.39 0.00 0.42 ASN 201 0.27 0.00 0.15 0.00 0.43 LYS 202 0.13 0.00 0.33 0.00 0.51 GLU 203 0.09 0.00 0.56 0.00 3.27 ILE 204 0.18 0.00 0.64 0.00 0.89 ASP 205 0.11 0.00 0.48 0.00 1.29 LEU 206 0.21 0.00 0.55 0.00 1.29 VAL 207 0.14 0.00 0.64 0.00 0.87 ALA 208 0.17 0.00 0.41 0.00 0.57 PRO 209 0.17 0.00 0.67 0.00 0.00 GLY 210 0.17 0.00 0.48 0.00 0.83 GLU 211 0.26 0.00 0.37 0.00 0.37 ASN 212 0.16 0.00 0.34 0.00 3.16 ILE 213 0.19 0.00 0.47 0.00 1.21 LEU 214 0.16 0.00 0.19 0.00 0.20 SER 215 0.13 0.00 0.26 0.00 0.25 THR 216 0.12 0.00 0.23 0.00 0.91 LEU 217 0.11 0.00 0.31 0.00 0.36 PRO 218 0.13 0.00 0.31 0.00 0.63 ASN 219 0.11 0.00 0.35 0.00 0.58 LYS 220 0.10 0.00 0.29 0.00 0.66 LYS 221 0.11 0.00 0.19 0.00 0.40 TYR 222 0.22 0.00 0.44 0.00 0.00 GLY 223 0.19 0.00 0.23 0.00 0.63 LYS 224 0.17 0.00 0.39 0.00 1.08 LEU 225 0.13 0.00 0.28 0.00 0.60 THR 226 0.12 0.00 0.28 0.00 0.00 GLY 227 0.10 0.00 0.23 0.00 0.23 THR 228 0.10 0.00 0.33 0.00 0.50 SER 229 0.09 0.00 0.32 0.00 0.54 MET 230 0.08 0.00 0.46 0.00 0.63 ALA 231 0.10 0.00 0.54 0.00 0.55 ALA 232 0.11 0.00 0.40 0.00 0.43 PRO 233 0.11 0.00 0.24 0.00 0.22 HIS 234 0.11 0.00 0.15 0.00 1.10 VAL 235 0.11 0.00 0.20 0.00 0.46 SER 236 0.11 0.00 0.36 0.00 0.00 GLY 237 0.13 0.00 0.31 0.00 0.20 ALA 238 0.13 0.00 0.33 0.00 0.83 LEU 239 0.12 0.00 0.46 0.00 0.43 ALA 240 0.15 0.00 0.39 0.00 0.57 LEU 241 0.12 0.00 0.26 0.00 2.87 ILE 242 0.12 0.00 0.37 0.00 0.60 LYS 243 0.12 0.00 0.72 0.00 0.79 SER 244 0.12 0.00 0.78 0.00 0.54 TYR 245 0.09 0.00 0.65 0.00 0.96 GLU 246 0.24 0.00 0.69 0.00 0.59 GLU 247 0.19 0.00 1.17 0.00 0.93 GLU 248 0.24 0.00 1.38 0.00 1.22 SER 249 0.27 0.00 0.94 0.00 0.85 PHE 250 0.26 0.00 0.90 0.00 0.98 GLN 251 0.15 0.00 0.84 0.00 1.15 ARG 252 0.15 0.00 0.96 0.00 0.93 LYS 253 0.25 0.00 0.85 0.00 1.22 LEU 254 0.19 0.00 0.65 0.00 0.58 SER 255 0.15 0.00 0.61 0.00 0.97 GLU 256 0.13 0.00 0.59 0.00 0.93 SER 257 0.15 0.00 0.52 0.00 0.90 GLU 258 0.12 0.00 0.33 0.00 1.26 VAL 259 0.12 0.00 0.36 0.00 0.69 PHE 260 0.12 0.00 0.47 0.00 0.63 ALA 261 0.13 0.00 0.44 0.00 0.53 GLN 262 0.10 0.00 0.80 0.00 1.34 LEU 263 0.18 0.00 0.69 0.00 2.44 ILE 264 0.12 0.00 0.59 0.00 0.64 ARG 265 0.26 0.00 0.52 0.00 0.67 ARG 266 0.32 0.00 0.43 0.00 0.51 THR 267 0.16 0.00 0.62 0.00 1.27 LEU 268 0.28 0.00 1.08 0.00 1.25 PRO 269 0.31 0.00 0.55 0.00 0.80 LEU 270 0.28 0.00 0.71 0.00 1.03 ASP 271 0.22 0.00 0.61 0.00 2.97 ILE 272 0.16 0.00 0.48 0.00 0.64 ALA 273 0.21 0.00 0.70 0.00 0.58 LYS 274 0.18 0.00 0.67 0.00 0.72 THR 275 0.25 0.00 0.27 0.00 1.31 LEU 276 0.17 0.00 0.61 0.00 0.65 ALA 277 0.11 0.00 0.46 0.00 0.00 GLY 278 0.10 0.00 0.27 0.00 0.49 ASN 279 0.25 0.00 0.57 0.00 0.00 GLY 280 0.39 0.00 1.11 0.00 0.55 PHE 281 0.26 0.00 1.82 0.00 1.27 LEU 282 0.74 0.00 2.76 0.00 1.45 TYR 283 1.08 0.00 5.65 0.00 6.44 LEU 284 1.59 0.00 6.51 0.00 4.86 THR 285 1.72 0.00 9.83 0.00 8.66 ALA 286 1.69 0.00 16.24 0.00 16.60 PRO 287 1.50 0.00 19.90 0.00 21.18 ASP 288 0.00 0.00 20.71 0.00303.76 GLU # ============== BESTFT ==================== #