# model1.pdb # model2.pdb # model3.pdb # model4.pdb # === XAM --> Examine Structures =========== # ============== BESTFT ==================== # # # # RMSD table* # # 1 2 3 4 # 1 0.77 1.47 1.56 # 2 1.84 1.39 1.53 # 3 2.66 2.54 0.83 # 4 2.76 2.67 1.92 # *En color verd es marquen els models més semblants i en vermell els que més difereixen entre sí. # Backbone atoms are : N CA C P O5' C5' C4' C3' O3' # # residues considered : 1..259 # # num. of residues considered: 259 (100%) # # mean global backbone RMSD : 1.26 +/- 0.33 A (0.77..1.56 A) # mean global heavy atom RMSD: 2.40 +/- 0.37 A (1.84..2.76 A) # # average rmsd of each struct. to the rest: # Structure 1 (BB): 1.27 +/- 0.35 A (0.77..1.56 A) # (H): 2.42 +/- 0.41 A (1.84..2.76 A) # Structure 2 (BB): 1.23 +/- 0.33 A (0.77..1.53 A) # (H): 2.35 +/- 0.36 A (1.84..2.67 A) # Structure 3 (BB): 1.23 +/- 0.29 A (0.83..1.47 A) # (H): 2.38 +/- 0.33 A (1.92..2.66 A) # Structure 4 (BB): 1.31 +/- 0.34 A (0.83..1.56 A) # (H): 2.45 +/- 0.38 A (1.92..2.76 A) # # The meaning of the first five columns is: # BB(local), Heavy(local), BB(global)*, Heavy(global), SC(side chain) * Cal fixar-se en aquests resultats: els valors destacats en vermell, corresponen a aquelles regions més variants (generalment pertanyen a loops) 5 25 0.00 0.00 0.47 0.45 0.00 GLY 26 0.06 1.16 0.60 1.59 2.14 ILE 27 0.03 1.16 0.62 2.44 3.24 LYS 28 0.03 1.10 0.44 0.37 0.37 VAL 29 0.08 1.07 0.52 1.30 1.75 ILE 30 0.09 1.14 0.69 1.79 2.39 LYS 31 0.08 0.91 0.61 0.60 0.68 ALA 32 0.05 1.07 0.53 0.66 0.81 PRO 33 0.05 1.39 0.51 2.12 2.85 GLU 34 0.06 1.65 0.47 2.03 2.83 MET 35 0.06 1.39 0.44 1.88 2.18 TRP 36 0.05 1.37 0.33 0.40 0.42 ALA 37 0.06 0.98 0.22 2.03 2.70 LYS 38 0.08 1.15 0.31 0.42 0.00 GLY 39 0.09 0.82 0.35 1.15 1.71 VAL 40 0.06 0.81 0.14 1.13 1.47 LYS 41 0.05 1.21 0.11 0.18 0.00 GLY 42 0.04 1.39 0.29 2.41 3.27 LYS 43 0.04 1.62 0.49 1.73 2.41 ASN 44 0.05 1.43 0.29 1.39 1.91 ILE 45 0.05 1.16 0.22 1.68 2.18 LYS 46 0.04 0.79 0.19 0.23 0.22 VAL 47 0.03 0.07 0.23 0.25 0.21 ALA 48 0.02 0.07 0.23 0.27 0.26 VAL 49 0.04 0.30 0.22 0.25 0.21 LEU 50 0.05 0.32 0.17 0.56 0.74 ASP 51 0.04 0.34 0.13 0.20 0.14 THR 52 0.04 0.37 0.23 0.27 0.00 GLY 53 0.10 0.56 0.29 0.80 1.27 CYS 54 0.07 0.72 0.54 0.75 0.87 ASP 55 0.10 0.68 0.61 1.06 1.38 THR 56 0.07 0.86 0.54 0.93 1.44 SER 57 0.05 0.73 0.33 0.89 1.10 HIS 58 0.07 0.63 0.22 0.43 0.50 PRO 59 0.20 0.85 0.25 0.52 0.59 ASP 60 0.79 1.59 0.96 1.85 2.18 LEU 61 0.97 2.17 2.95 4.77 5.58 LYS 62 0.88 2.69 2.77 4.62 5.81 ASN 63 0.96 1.99 2.61 5.48 6.86 GLN 64 0.79 1.57 1.01 1.32 1.47 ILE 65 0.44 0.84 0.99 1.59 1.38 ILE 66 0.32 0.80 0.95 0.94 0.00 GLY 67 0.19 1.20 0.52 0.60 0.00 GLY 68 0.19 1.48 0.18 2.55 3.46 LYS 69 0.17 1.63 0.26 1.52 2.07 ASN 70 0.27 1.04 0.39 1.27 1.54 PHE 71 0.61 1.53 1.34 2.22 2.70 THR 72 0.76 1.76 2.05 3.92 5.08 ASP 73 0.68 1.90 2.26 4.06 4.91 ASP 74 0.73 1.49 2.11 3.20 3.80 ASP 75 0.72 1.39 2.74 2.82 0.00 GLY 76 0.78 1.51 1.26 1.18 0.00 GLY 77 0.48 1.20 1.04 2.83 3.63 LYS 78 0.31 1.57 1.60 2.59 3.02 GLU 79 0.65 1.54 1.97 3.94 5.18 ASP 80 0.63 1.88 2.61 3.16 4.49 ALA 81 0.44 1.13 1.85 2.40 2.62 ILE 82 0.27 1.02 0.62 0.92 1.29 SER 83 0.16 1.26 0.50 0.41 0.30 ASP 84 0.05 0.97 0.45 2.61 3.23 TYR 85 0.06 1.01 0.34 0.51 0.66 ASN 86 0.05 0.28 0.20 0.20 0.00 GLY 87 0.03 0.15 0.14 0.43 0.48 HIS 88 0.04 0.16 0.18 0.23 0.00 GLY 89 0.02 0.07 0.16 0.22 0.18 THR 90 0.02 0.08 0.13 0.28 0.25 HIS 91 0.02 0.09 0.15 0.22 0.17 VAL 92 0.04 0.07 0.18 0.21 0.19 ALA 93 0.03 0.05 0.20 0.25 0.00 GLY 94 0.03 0.56 0.20 0.25 0.19 THR 95 0.05 0.57 0.23 1.05 1.41 ILE 96 0.05 0.60 0.23 0.28 0.28 ALA 97 0.06 0.62 0.27 0.34 0.41 ALA 98 0.05 0.90 0.22 1.17 1.66 ASN 99 0.06 0.96 0.29 1.15 1.58 ASP 100 0.14 1.22 0.50 0.89 1.32 SER 101 0.14 1.15 0.57 2.01 2.71 ASN 102 0.15 1.06 0.40 0.40 0.00 GLY 103 0.10 0.94 0.32 0.34 0.00 GLY 104 0.04 0.93 0.23 1.49 2.07 ILE 105 0.04 0.94 0.15 0.23 0.15 ALA 106 0.04 0.08 0.16 0.23 0.00 GLY 107 0.04 0.08 0.16 0.27 0.28 VAL 108 0.05 0.25 0.11 0.19 0.14 ALA 109 0.04 0.98 0.09 0.55 0.74 PRO 110 0.04 0.93 0.15 1.78 2.44 GLU 111 0.06 1.00 0.17 0.21 0.17 ALA 112 0.05 0.64 0.10 0.82 1.38 SER 113 0.04 0.74 0.12 0.82 1.15 LEU 114 0.06 1.10 0.17 0.83 1.13 LEU 115 0.07 0.98 0.20 1.51 2.09 ILE 116 0.08 0.84 0.20 0.28 0.26 VAL 117 0.13 0.51 0.11 0.32 0.38 LYS 118 0.25 0.73 0.38 0.89 1.27 VAL 119 0.58 1.02 0.58 0.90 0.95 LEU 120 0.96 1.40 2.08 2.16 0.00 GLY 121 0.90 1.68 2.22 2.40 0.00 GLY 122 0.71 1.67 2.07 4.24 5.33 GLU 123 0.52 1.59 0.77 1.86 2.57 ASN 124 0.34 1.12 0.50 0.53 0.00 GLY 125 0.15 0.49 0.37 0.85 1.29 SER 126 0.15 1.20 0.39 0.42 0.00 GLY 127 0.10 1.38 0.27 2.30 3.05 GLN 128 0.04 1.43 0.25 1.23 1.47 TYR 129 0.04 1.08 0.29 1.16 1.46 GLU 130 0.03 0.95 0.26 1.23 1.48 TRP 131 0.05 0.87 0.20 0.70 0.92 ILE 132 0.03 0.80 0.22 0.89 1.17 ILE 133 0.02 0.76 0.25 0.77 1.04 ASN 134 0.02 0.78 0.28 0.27 0.00 GLY 135 0.03 0.76 0.27 1.01 1.40 ILE 136 0.03 0.67 0.27 0.73 0.95 ASN 137 0.03 0.45 0.30 0.84 1.05 TYR 138 0.08 0.66 0.31 0.31 0.35 ALA 139 0.23 1.07 0.35 1.15 1.69 VAL 140 0.50 1.99 1.23 2.19 2.66 GLU 141 0.82 2.48 2.16 4.18 5.17 GLN 142 0.63 2.28 2.42 4.50 5.69 LYS 143 0.44 1.58 0.70 1.12 1.48 VAL 144 0.23 0.93 0.40 0.57 0.67 ASP 145 0.05 0.86 0.28 1.17 1.58 ILE 146 0.04 0.88 0.30 1.13 1.53 ILE 147 0.08 0.69 0.25 0.30 0.27 SER 148 0.14 0.55 0.20 0.52 0.64 MET 149 0.20 0.71 0.59 1.08 1.43 SER 150 0.22 0.73 0.55 1.15 1.48 LEU 151 0.22 0.61 0.56 0.63 0.00 GLY 152 0.15 0.25 0.59 0.70 0.00 GLY 153 0.10 0.35 0.65 0.75 0.60 PRO 154 0.11 0.57 0.75 0.97 1.11 SER 155 0.15 0.78 0.77 1.28 1.43 ASP 156 0.10 0.76 0.80 1.31 1.70 VAL 157 0.07 0.87 0.86 0.99 1.14 PRO 158 0.05 0.90 1.04 2.34 2.93 GLU 159 0.04 1.16 0.74 1.06 1.24 LEU 160 0.04 1.26 0.56 1.70 2.23 LYS 161 0.03 1.16 0.77 2.53 3.30 GLU 162 0.06 1.10 0.71 0.76 0.77 ALA 163 0.06 1.23 0.50 1.23 1.72 VAL 164 0.05 1.47 0.76 2.13 2.68 LYS 165 0.04 1.25 1.10 2.10 2.62 ASN 166 0.04 1.03 0.93 0.98 0.75 ALA 167 0.04 1.19 0.97 1.36 1.59 VAL 168 0.12 1.34 1.38 3.53 4.43 LYS 169 0.31 1.47 1.26 2.13 2.48 ASN 170 0.28 0.97 1.28 1.26 0.00 GLY 171 0.17 0.68 0.85 0.94 0.92 VAL 172 0.09 0.62 0.52 1.42 1.87 LEU 173 0.06 0.62 0.44 0.51 0.53 VAL 174 0.04 0.52 0.21 0.30 0.28 VAL 175 0.06 0.53 0.14 1.00 1.67 CYS 176 0.09 0.57 0.23 0.32 0.28 ALA 177 0.05 0.09 0.27 0.33 0.35 ALA 178 0.08 0.26 0.18 0.22 0.00 GLY 179 0.09 0.72 0.25 0.51 0.62 ASN 180 0.21 0.79 0.37 1.46 1.81 GLU 181 0.67 2.18 0.54 1.03 0.00 GLY 182 0.73 1.34 2.71 5.08 6.42 ASP 183 0.84 1.72 3.35 3.48 0.00 GLY 184 0.93 1.91 3.04 5.26 6.62 ASP 185 0.86 2.59 4.00 6.32 7.93 GLU 186 0.96 2.43 5.31 9.58 11.43 ARG 187 0.47 2.29 3.55 3.70 3.83 THR 188 0.57 1.46 3.26 4.85 5.73 GLU 189 0.51 1.78 3.65 6.10 7.23 GLU 190 0.81 1.89 2.62 4.72 6.19 LEU 191 0.61 1.98 0.98 1.71 2.50 SER 192 0.31 0.88 0.47 1.13 1.27 TYR 193 0.05 0.68 0.41 0.48 0.44 PRO 194 0.06 0.08 0.26 0.34 0.27 ALA 195 0.04 0.11 0.31 0.43 0.43 ALA 196 0.05 0.79 0.16 0.38 0.38 TYR 197 0.07 1.28 0.28 1.68 2.37 ASN 198 0.06 1.38 0.32 2.02 2.61 GLU 199 0.06 1.38 0.27 1.14 1.64 VAL 200 0.06 0.94 0.31 1.27 1.72 ILE 201 0.09 0.75 0.32 0.43 0.33 ALA 202 0.04 0.06 0.23 0.33 0.25 VAL 203 0.04 0.40 0.19 0.29 0.00 GLY 204 0.07 0.74 0.23 0.86 1.28 SER 205 0.09 0.83 0.19 0.86 1.24 VAL 206 0.08 0.69 0.51 1.09 1.59 SER 207 0.04 0.37 0.88 1.06 1.19 VAL 208 0.06 1.16 0.82 0.87 0.98 ALA 209 0.06 1.31 0.55 2.46 3.02 ARG 210 0.07 1.44 0.54 1.80 2.28 GLU 211 0.12 1.02 0.49 1.30 1.61 LEU 212 0.12 1.29 0.38 0.48 0.41 SER 213 0.04 1.02 0.46 2.04 2.72 GLU 214 0.04 1.04 0.40 0.49 0.40 PHE 215 0.12 0.73 0.33 0.69 0.88 SER 216 0.14 0.82 0.56 1.33 1.69 ASN 217 0.26 1.21 1.08 1.31 1.73 ALA 218 0.32 1.25 1.00 2.19 2.88 ASN 219 0.41 1.72 0.80 2.09 2.62 LYS 220 0.33 1.42 0.80 1.73 2.06 GLU 221 0.09 1.02 0.68 1.54 1.94 ILE 222 0.08 1.07 0.56 0.73 0.68 ASP 223 0.07 0.94 0.31 1.59 2.16 LEU 224 0.12 1.01 0.24 0.84 1.20 VAL 225 0.08 0.46 0.20 0.30 0.39 ALA 226 0.17 0.21 0.23 0.44 0.50 PRO 227 0.17 0.85 0.33 0.38 0.00 GLY 228 0.16 1.30 0.19 1.59 2.21 GLU 229 0.05 1.25 0.16 1.78 2.48 ASN 230 0.05 1.03 0.12 0.62 0.86 ILE 231 0.04 0.72 0.13 0.98 1.39 LEU 232 0.04 0.78 0.09 0.51 0.75 SER 233 0.03 1.00 0.13 0.76 1.04 THR 234 0.05 0.94 0.13 1.33 1.90 LEU 235 0.06 1.27 0.19 0.26 0.15 PRO 236 0.08 1.17 0.34 1.87 2.57 ASN 237 0.05 1.34 0.18 1.28 1.71 LYS 238 0.06 1.04 0.10 1.32 1.76 LYS 239 0.05 0.83 0.08 0.81 0.96 TYR 240 0.05 1.26 0.09 0.18 0.00 GLY 241 0.05 1.09 0.10 2.34 3.11 LYS 242 0.05 1.20 0.18 1.26 1.74 LEU 243 0.04 0.98 0.19 1.01 1.45 THR 244 0.02 0.77 0.17 0.23 0.00 GLY 245 0.04 0.60 0.14 0.75 1.08 THR 246 0.03 0.62 0.12 0.58 0.92 SER 247 0.02 0.38 0.09 0.51 0.69 MET 248 0.02 0.27 0.10 0.16 0.12 ALA 249 0.03 0.13 0.12 0.18 0.11 ALA 250 0.03 0.52 0.18 0.35 0.44 PRO 251 0.03 0.69 0.20 0.83 1.06 HIS 252 0.02 0.68 0.24 0.76 1.07 VAL 253 0.03 0.42 0.24 0.27 0.26 SER 254 0.02 0.04 0.23 0.27 0.00 GLY 255 0.04 0.79 0.22 0.29 0.33 ALA 256 0.05 0.82 0.17 1.47 2.02 LEU 257 0.04 1.03 0.21 0.29 0.25 ALA 258 0.04 0.65 0.36 1.25 1.66 LEU 259 0.04 0.81 0.37 0.52 0.48 ILE 260 0.04 0.67 0.31 1.12 1.39 LYS 261 0.04 0.97 0.45 0.93 1.37 SER 262 0.07 1.03 0.68 1.56 1.75 TYR 263 0.14 1.32 0.70 1.23 1.47 GLU 264 0.38 1.69 0.70 1.74 2.25 GLU 265 0.59 1.64 1.67 3.28 3.99 GLU 266 0.91 2.15 3.09 3.60 4.33 SER 267 0.87 1.93 4.66 6.71 7.55 PHE 268 0.67 1.93 5.06 6.79 8.01 GLN 269 0.93 2.77 5.02 8.79 10.61 ARG 270 0.94 2.54 3.56 5.61 6.88 LYS 271 0.87 2.32 1.22 3.28 4.39 LEU 272 0.45 1.64 0.78 1.45 2.11 SER 273 0.12 0.99 0.63 1.64 2.05 GLU 274 0.05 1.09 0.68 1.17 1.68 SER 275 0.03 1.06 0.64 1.91 2.44 GLU 276 0.04 0.97 0.48 1.19 1.61 VAL 277 0.04 0.56 0.39 0.68 0.79 PHE 278 0.03 0.97 0.43 0.59 0.57 ALA 279 0.02 0.98 0.58 1.81 2.27 GLN 280 0.05 1.14 0.52 0.68 0.63 LEU 281 0.10 1.18 0.51 1.17 1.40 ILE 282 0.10 2.36 0.78 2.36 2.95 ARG 283 0.00 0.00 0.83 4.18 5.18 ARG # ============== BESTFT ==================== #