CLUSTAL W(1.60) multiple sequence alignment

P11018.ss2Seq        MNGEIRLIPYVTNEQIMDVNELPEGIKVIKAPEMWAKGVKGKNIKVAVLDTGCDTSHPDL
P11018.ss2SS         CCCCEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHH
probl1amb3.dsspSS    --S-------SS---SS-SS---HHHHHHTHHHHHHHT---TT-EEEEEES---TT-TT-
probl1amb3_2.dsspSS  -----S-----SS---S-SS---HHHHHHTHHHHHHHT-S-TT-EEEEEES---TT-TTS
probl2amb2.dsspSS    --S--S-------S--S--S---HHHHHTTHHHHHHHT-S-TT-EEEEEES---TT-GGG
probl2amb2_2.dsspSS  -----SSS-----------S---HHHHHTTHHHHHHHT---TT-EEEEEES---TT-GGG

P11018.ss2Seq        KNQIIGGKNFTDDDGGKEDAISDYNGHGTHVAGTIAANDSNGGIAGVAPEASLLIVKVLG
P11018.ss2SS         HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCEEEEEEEEC
probl1amb3.dsspSS    -TTT-EEEE---SSS----TT--SSSHHHHHHHHHH---SSSS---SSTT-EEEEEE-S-
probl1amb3_2.dsspSS  -SS--EEEE---SSS----TT--SSSHHHHHHHHHH---SSSS---SSTT-EEEEEE-S-
probl2amb2.dsspSS    TS-EEEEEE---TTT--SS--S-SSSHHHHHHHHHH---SSSS---SSTTSEEEEEESS-
probl2amb2_2.dsspSS  TS-EEEEEE---TTT---STT--SSSHHHHHHHHHH---SSSS---SSTTSEEEEEES--

P11018.ss2Seq        GENGSGQYEWIINGINYAVEQKVDIISMSLGGPSDVPELKEAVKNAVKNGVLVVCAAGNE
P11018.ss2SS         CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCC
probl1amb3.dsspSS    TTTS---HHHHHHHHHHHHHHT-SEEEE---BSS--HHHHHHHHHHHHHT-EEEEE--S-
probl1amb3_2.dsspSS  TTT----HHHHHHHHHHHHHHT-SEEEE---BSS--HHHHHHHHHHHHTT-EEEEE--S-
probl2amb2.dsspSS    -SSS---HHHHHHHHHHHHSSSEEEEEE---BSS--HHHHHHHHHHHHTT-EEEEE--S-
probl2amb2_2.dsspSS  -SSS---HHHHHHHHHHHTTSSEEEEEE---BSS--HHHHHHHHHHHHTT-EEEEE--SS

P11018.ss2Seq        GDGDERTEELSYPAAYNEVIAVGSVSVARELSEFSNANKEIDLVAPGENILSTLPNKKYG
P11018.ss2SS         CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEECCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCEEE
probl1amb3.dsspSS    -S-SSSS----BTTTSTTSEEEEEE-TTS-B-TTS---TT--EEEE-SSEEEEETTTEEE
probl1amb3_2.dsspSS  -S-STT-----BTTTSTTSEEEEEE-TTS-B-TTS---TT--EEEE-SSEEEEETTTEEE
probl2amb2.dsspSS    --SSS-BTTTSBTTTSTTEEEEEEE-TTS-B-TT--BSTTEEEEEE-SSEEEEETTTEEE
probl2amb2_2.dsspSS  -TTTS-BTTTSBTTTSTTSEEEEEE-TTSSB-TT--BSTTEEEEEE-SSEEEEETTTEEE

P11018.ss2Seq        KLTGTSMAAPHVSGALALIKSYEEESFQRKLSESEVFAQLIRRTLPLDIAKTLAGNGFLY
P11018.ss2SS         EECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCEEEEE
probl1amb3.dsspSS    EE-SHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSB-SSSB--HHHHHHHHHHT-B-S-S-HHHHTT-B--
probl1amb3_2.dsspSS  EE-SHHHHHHHHHHHHHHHHHHT--SSSS---HHHHHHHHHHH-B-S-S-HHHHTT-B--
probl2amb2.dsspSS    EE-SHHHHHHHHHHHHHHHHHHS-SSSTT---HHHHHHHHHHT-B--SS-HHHHTT-B--
probl2amb2_2.dsspSS  EE-SHHHHHHHHHHHHHHHHHHT-SBSSSBSSHHHHHHHHHHT-B--SS-HHHHTT-B--

P11018.ss2Seq        LTAPDELAEKAEQSHLLTL
P11018.ss2SS         EEHHHHHHHHHHHCCCCCC
probl1amb3.dsspSS    SHHHHT-------------
probl1amb3_2.dsspSS  THHHHT------S------
probl2amb2.dsspSS    STTTTSS------------
probl2amb2_2.dsspSS  STTTTT---S----SSS--