CLUSTAL W(1.60) multiple sequence alignment



1ak9.dsspS      -----HHHHHTTHHHHHHHT-S-TT-EEEEEES---TT-TT----EEEEEE---BTTB--
1sca.dsspS      -----THHHHTTHHHHHHTT-S-TT-EEEEEES---TT-TT----EEEEEE---STT---
1scj.dsspS      -----HHHHHTTHHHHHHHT-S-TT-EEEEEES---TT-TT----EEEEEE----TT---
1ubn.dsspS      -B---HHHHHTTHHHHHHTT-S-TT-EEEEEES---TTSTT----EEEEEE----SS---
modelopt.d      -EE--HHHHHTTHHHHHHTT-S--S-EEEEEES---TT-TTB-S-EEEEEE---SSS---
clu1.dsspS      -----HHHHHTTHHHHHHHT---TT-EEEEEES---TT-TT--S-EEEEEE---SSS---
                      ************ *    . *******   ** **    ******    ..   

1ak9.dsspS      -TT--SSSHHHHHHHHHH---SSSSS----SSTTSEEEEEE-S-TTS----HHHHHHHHH
1sca.dsspS      -TT--SSSHHHHHHHHHH---SSSSS----SSTTSEEEEEE-S-TTS----HHHHHHHHH
1scj.dsspS      -TT--SSSHHHHHHHHHH----SSSS----SSTT-EEEEEE-S-TTS----HHHHHHHHH
1ubn.dsspS      -TT--SSSHHHHHHHHHH----SSSSB---SSTTSEEEEEE-S-TTS----HHHHHHHHH
modelopt.d      -TT--SSSHHHHHHHHHHB---SSSSEE--SSTT-EEEEEE-S-TTT----HHHHHHHHH
clu1.dsspS      -TT--SSSHHHHHHHHHH----SSSSS---SSTTSEEEEEE-S-TTTS---HHHHHHHHH
                 **  *************    ****    **** ****** * **.    *********

1ak9.dsspS      HHHHTT-SEEEE---BS---HHHHHHHHHHHHTT-EEEEE--S----BTTB----BTTTS
1sca.dsspS      HHHHTT-SEEEE---BS---HHHHHHHHHHHHTT-EEEEE--S-----TT-----BTTTS
1scj.dsspS      HHHHTT-SEEEE---BS---HHHHHHHHHHHHTT-EEEEE--S----BTTB----BTTTS
1ubn.dsspS      HHHHTT-SEEEE---BS---HHHHHHHHHHHHTT-EEEEE--S----BTTB----BTTTS
modelopt.d      HHHHTT-SEEEE---BS---HHHHHHHHHHHHTT-EEEEE--S---SSTTS----BTTTS
clu1.dsspS      HHHHTT-SEEEE---BS---HHHHHHHHHHHHHT-EEEEE--S----STT-----BTTTS
                ****** *****   **   ************ * *****  *     **     *****

1ak9.dsspS      TTSEEEEEE-TTS-B-TT---STTEEEEEE-SSEEEEETTTEEEEE-SHHHHHHHHHHHH
1sca.dsspS      TTSEEEEEE-TTS-B-TT---STT--EEEE-SSEEEEETTTEEEEE-SHHHHHHHHHHHH
1scj.dsspS      TTSEEEEEE-TTS-B-TTS--STT--EEEE-SSEEEEETTTEEEEE-SHHHHHHHHHHHH
1ubn.dsspS      TTSEEEEEE-TTS-B-TTS--STT--EEEE-SSEEEEETTTEEEEE------HHHHHHHH
modelopt.d      TTSEEEEEE-TTSSB-TT----TT--EEEE-S-EEEEETTTEEEEE-SHHHHHHHHHHHH
clu1.dsspS      TTSEEEEEE-TTS-B-TTS--STT--EEEE-SSEEEEETTTEEEEE-SHHHHHHHHHHHH
                ********* *** * **    **  **** * *************      ********

1ak9.dsspS      HHHHHH-----TT---HHHHHHHHHHT-B-------HHHHTT-B--HHHHH--
1sca.dsspS      HHHHHH-----TT---HHHHHHHHHHT-B-----S-HHHHTT-B--HHHHT--
1scj.dsspS      HHHHHH-----TT---HHHHHHHHHHTSB-----S-HHHHTT-B--HHHHT--
1ubn.dsspS      HHHHHH-----TT---HHHHHHHHHHT-B-----S-HHHHTT-B--HHHHH--
modelopt.d      HHHHHHS-SBTTTB--HHHHHHHHHHSEE----SS-HHHHTT----EE-TT--
clu1.dsspS      HHHHHHS-SSSSS---HHHHHHHHHHT-B-----S-HHHHTT----B--SS--
                ******     ..   **********.         ******