INTRODUCCIÓ
LA FAMÍLIA DE LES ADHs
Les
alcohol deshidrogenases són un conjunt molt homogeni i conservat de
metalo-enzims. Formen dímers o tetràmers,
cada monòmer s’uneix a dos cofactors: un àtom de zinc (com a mínim) pel domini
d’unió a Zn i a un NAD+ o NADP pel domini d’unió al coenzim. A més de
la unió als cofactors, es requereix la unió del substrat alcohòlic, pel domini
catalític, per dur a terme l’oxidació reversible a aldehids o cetones:
La família
d’ADH pertany a una superfamília de proteïnes GroES-like. La funció de les ADH és universal, es troba en bactèries, mamífers, plantes i fongs; això
indica una existència prèvia a la diversificació dels organismes
multicel·lulars (fa més de 500 milions d’anys). Les diferents espècies també
presenten isoformes diferents de la proteïna (isoenzims), en funció dels
requeriments metabòlics afavorits per la Selecció Natural, al llarg de
l’evolució. Cada isoenzim pot estar format per
subunitats idèntiques (homodímer o homotetràmer) o subunitats diferents
(heterodímer o heterotetràmer). L’essencialitat de la seva
funció explica tant la seva conservació al llarg de l’evolució com
l’homogeneïtat de les seqüències (pocs canvis són admesos o seleccionats
positivament).
El treball
es basarà en construir un model estructural de la proteïna bacteriana ALCEU,
mitjançant eines bioinformàtiques.
PROTEÏNA ALCEU
La proteïna alceu (P14940), de la
família de les ADH, pertany a la bactèria Alcaligenes Eutrophus. Per poder
desenvolupar la seva activitat catalítica forma un homotetràmer i utilitza com
a cofactors NAD+ i Zn. Cada monòmer té 366 aminoàcids on es troben quatre
dominis: de dimerització, d’unió al zinc, d’unió al NAD i d’unió al substrat.
