MATERIAL I MÈTODES

 

*  Cerca de templates

 

*  Models inicials:

                   Model seqüencial

                   Model estructural

                   Anàlisi dels models

 

*  Models sense ratolí i bacallà:

                   Model seqüencial

                   Model estructural

                   Anàlisi dels models

 

*  Anàlisi del loop 90-130:

                   Regió del loop en els templates

                   Anàlisi de l’estructura secundària

                                 Anàlisi de la funció del loop

                                       Classificació del loop amb el programa ARCHTYPE     

                                       Modelatge del loop

                                       Model només amb bactèries

                                       Model només amb humà

                                       Conclusions

 

                     *  Model definitiu:

                   Construcció del model definitiu

                   Optimització

                   Dinàmica

                   B-Factor

 

 *  Construcció dels models amb cofactor:

                Model basat en humà: monòmer

                Model basat en bactèria: monòmer, dímer, tetràmer  

 

     *  Anàlisi del model ALCEU amb cofactors:

                                        Plegament

                                        Dominis i interaccions